Protein–RNA interactions for Protein: Q04743

EMX2, Homeobox protein EMX2, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX2Q04743 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.6 ms