Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.3 ms