Protein–RNA interactions for Protein: Q03519

TAP2, Antigen peptide transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 686 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAP2Q03519 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TAP2Q03519 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TAP2Q03519 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TAP2Q03519 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TAP2Q03519 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TAP2Q03519 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TAP2Q03519 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TAP2Q03519 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TAP2Q03519 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TAP2Q03519 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TAP2Q03519 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TAP2Q03519 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TAP2Q03519 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TAP2Q03519 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TAP2Q03519 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TAP2Q03519 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TAP2Q03519 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TAP2Q03519 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TAP2Q03519 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TAP2Q03519 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TAP2Q03519 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TAP2Q03519 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TAP2Q03519 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TAP2Q03519 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TAP2Q03519 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TAP2Q03519 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TAP2Q03519 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TAP2Q03519 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TAP2Q03519 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TAP2Q03519 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TAP2Q03519 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TAP2Q03519 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TAP2Q03519 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TAP2Q03519 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TAP2Q03519 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TAP2Q03519 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TAP2Q03519 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TAP2Q03519 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TAP2Q03519 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TAP2Q03519 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TAP2Q03519 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TAP2Q03519 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TAP2Q03519 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TAP2Q03519 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TAP2Q03519 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TAP2Q03519 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TAP2Q03519 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TAP2Q03519 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TAP2Q03519 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TAP2Q03519 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TAP2Q03519 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TAP2Q03519 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TAP2Q03519 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TAP2Q03519 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TAP2Q03519 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TAP2Q03519 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TAP2Q03519 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TAP2Q03519 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TAP2Q03519 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TAP2Q03519 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TAP2Q03519 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TAP2Q03519 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TAP2Q03519 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TAP2Q03519 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TAP2Q03519 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TAP2Q03519 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TAP2Q03519 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TAP2Q03519 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TAP2Q03519 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TAP2Q03519 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TAP2Q03519 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TAP2Q03519 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TAP2Q03519 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TAP2Q03519 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TAP2Q03519 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TAP2Q03519 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TAP2Q03519 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TAP2Q03519 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TAP2Q03519 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TAP2Q03519 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TAP2Q03519 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TAP2Q03519 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TAP2Q03519 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TAP2Q03519 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TAP2Q03519 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TAP2Q03519 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TAP2Q03519 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TAP2Q03519 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TAP2Q03519 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TAP2Q03519 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TAP2Q03519 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TAP2Q03519 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
TAP2Q03519 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TAP2Q03519 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TAP2Q03519 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TAP2Q03519 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TAP2Q03519 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TAP2Q03519 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TAP2Q03519 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TAP2Q03519 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms