Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms