Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC42EP1Q00587 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC42EP1Q00587 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC42EP1Q00587 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC42EP1Q00587 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC42EP1Q00587 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC42EP1Q00587 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC42EP1Q00587 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC42EP1Q00587 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC42EP1Q00587 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC42EP1Q00587 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC42EP1Q00587 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC42EP1Q00587 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC42EP1Q00587 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC42EP1Q00587 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC42EP1Q00587 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC42EP1Q00587 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC42EP1Q00587 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC42EP1Q00587 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC42EP1Q00587 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC42EP1Q00587 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC42EP1Q00587 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC42EP1Q00587 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC42EP1Q00587 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC42EP1Q00587 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC42EP1Q00587 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC42EP1Q00587 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC42EP1Q00587 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC42EP1Q00587 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC42EP1Q00587 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC42EP1Q00587 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC42EP1Q00587 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC42EP1Q00587 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC42EP1Q00587 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC42EP1Q00587 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC42EP1Q00587 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC42EP1Q00587 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC42EP1Q00587 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC42EP1Q00587 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC42EP1Q00587 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC42EP1Q00587 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC42EP1Q00587 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC42EP1Q00587 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC42EP1Q00587 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC42EP1Q00587 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDC42EP1Q00587 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDC42EP1Q00587 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDC42EP1Q00587 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDC42EP1Q00587 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDC42EP1Q00587 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDC42EP1Q00587 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDC42EP1Q00587 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDC42EP1Q00587 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDC42EP1Q00587 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDC42EP1Q00587 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDC42EP1Q00587 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDC42EP1Q00587 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDC42EP1Q00587 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDC42EP1Q00587 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDC42EP1Q00587 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDC42EP1Q00587 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDC42EP1Q00587 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDC42EP1Q00587 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDC42EP1Q00587 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CDC42EP1Q00587 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CDC42EP1Q00587 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CDC42EP1Q00587 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDC42EP1Q00587 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDC42EP1Q00587 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDC42EP1Q00587 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDC42EP1Q00587 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDC42EP1Q00587 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDC42EP1Q00587 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDC42EP1Q00587 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDC42EP1Q00587 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDC42EP1Q00587 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDC42EP1Q00587 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDC42EP1Q00587 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDC42EP1Q00587 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDC42EP1Q00587 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDC42EP1Q00587 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDC42EP1Q00587 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDC42EP1Q00587 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDC42EP1Q00587 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDC42EP1Q00587 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDC42EP1Q00587 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDC42EP1Q00587 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDC42EP1Q00587 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDC42EP1Q00587 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDC42EP1Q00587 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDC42EP1Q00587 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDC42EP1Q00587 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDC42EP1Q00587 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDC42EP1Q00587 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDC42EP1Q00587 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDC42EP1Q00587 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDC42EP1Q00587 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDC42EP1Q00587 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDC42EP1Q00587 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDC42EP1Q00587 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms