Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATP2C1P98194 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATP2C1P98194 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATP2C1P98194 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATP2C1P98194 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATP2C1P98194 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP2C1P98194 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP2C1P98194 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP2C1P98194 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP2C1P98194 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP2C1P98194 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP2C1P98194 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP2C1P98194 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP2C1P98194 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP2C1P98194 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP2C1P98194 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP2C1P98194 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP2C1P98194 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP2C1P98194 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP2C1P98194 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP2C1P98194 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP2C1P98194 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP2C1P98194 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP2C1P98194 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP2C1P98194 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP2C1P98194 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP2C1P98194 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP2C1P98194 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP2C1P98194 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP2C1P98194 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP2C1P98194 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP2C1P98194 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP2C1P98194 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP2C1P98194 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP2C1P98194 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP2C1P98194 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP2C1P98194 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP2C1P98194 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP2C1P98194 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP2C1P98194 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP2C1P98194 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP2C1P98194 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP2C1P98194 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP2C1P98194 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP2C1P98194 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP2C1P98194 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP2C1P98194 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP2C1P98194 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP2C1P98194 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP2C1P98194 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP2C1P98194 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP2C1P98194 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP2C1P98194 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP2C1P98194 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP2C1P98194 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP2C1P98194 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP2C1P98194 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP2C1P98194 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP2C1P98194 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP2C1P98194 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP2C1P98194 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP2C1P98194 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP2C1P98194 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP2C1P98194 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP2C1P98194 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP2C1P98194 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP2C1P98194 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP2C1P98194 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP2C1P98194 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP2C1P98194 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP2C1P98194 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP2C1P98194 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP2C1P98194 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP2C1P98194 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP2C1P98194 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP2C1P98194 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP2C1P98194 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP2C1P98194 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP2C1P98194 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP2C1P98194 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP2C1P98194 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP2C1P98194 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP2C1P98194 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP2C1P98194 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP2C1P98194 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP2C1P98194 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP2C1P98194 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP2C1P98194 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP2C1P98194 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP2C1P98194 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP2C1P98194 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms