Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC14.09□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC14.08□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms