Protein–RNA interactions for Protein: P62701

RPS4X, 40S ribosomal protein S4, X isoform, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS4XP62701 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPS4XP62701 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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