Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UFM1P61960 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UFM1P61960 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UFM1P61960 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UFM1P61960 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UFM1P61960 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UFM1P61960 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UFM1P61960 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UFM1P61960 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UFM1P61960 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UFM1P61960 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UFM1P61960 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UFM1P61960 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UFM1P61960 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UFM1P61960 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UFM1P61960 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UFM1P61960 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UFM1P61960 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UFM1P61960 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UFM1P61960 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UFM1P61960 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UFM1P61960 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UFM1P61960 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UFM1P61960 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UFM1P61960 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UFM1P61960 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UFM1P61960 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
UFM1P61960 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UFM1P61960 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UFM1P61960 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UFM1P61960 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UFM1P61960 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UFM1P61960 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UFM1P61960 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UFM1P61960 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UFM1P61960 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UFM1P61960 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UFM1P61960 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UFM1P61960 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UFM1P61960 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UFM1P61960 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UFM1P61960 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UFM1P61960 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UFM1P61960 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UFM1P61960 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UFM1P61960 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UFM1P61960 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UFM1P61960 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UFM1P61960 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UFM1P61960 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UFM1P61960 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UFM1P61960 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UFM1P61960 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UFM1P61960 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UFM1P61960 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UFM1P61960 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UFM1P61960 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UFM1P61960 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UFM1P61960 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UFM1P61960 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UFM1P61960 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UFM1P61960 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UFM1P61960 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UFM1P61960 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UFM1P61960 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UFM1P61960 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UFM1P61960 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UFM1P61960 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UFM1P61960 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UFM1P61960 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
UFM1P61960 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
UFM1P61960 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
UFM1P61960 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UFM1P61960 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UFM1P61960 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UFM1P61960 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UFM1P61960 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UFM1P61960 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UFM1P61960 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
UFM1P61960 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UFM1P61960 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UFM1P61960 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UFM1P61960 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UFM1P61960 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UFM1P61960 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UFM1P61960 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UFM1P61960 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UFM1P61960 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UFM1P61960 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UFM1P61960 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UFM1P61960 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UFM1P61960 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UFM1P61960 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UFM1P61960 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UFM1P61960 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UFM1P61960 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UFM1P61960 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UFM1P61960 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UFM1P61960 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UFM1P61960 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms