Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms