Protein–RNA interactions for Protein: P59894

DCDC1, Doublecortin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCDC1P59894 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms