Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EEFSECP57772 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EEFSECP57772 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EEFSECP57772 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EEFSECP57772 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EEFSECP57772 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EEFSECP57772 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EEFSECP57772 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EEFSECP57772 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EEFSECP57772 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EEFSECP57772 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EEFSECP57772 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
EEFSECP57772 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EEFSECP57772 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EEFSECP57772 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EEFSECP57772 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EEFSECP57772 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EEFSECP57772 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EEFSECP57772 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms