Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNB3P54284 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNB3P54284 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CACNB3P54284 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CACNB3P54284 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CACNB3P54284 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CACNB3P54284 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CACNB3P54284 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CACNB3P54284 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CACNB3P54284 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CACNB3P54284 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CACNB3P54284 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CACNB3P54284 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CACNB3P54284 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
CACNB3P54284 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CACNB3P54284 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNB3P54284 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNB3P54284 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNB3P54284 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNB3P54284 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNB3P54284 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNB3P54284 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNB3P54284 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNB3P54284 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNB3P54284 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNB3P54284 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNB3P54284 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNB3P54284 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNB3P54284 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNB3P54284 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNB3P54284 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNB3P54284 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNB3P54284 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNB3P54284 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNB3P54284 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNB3P54284 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNB3P54284 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNB3P54284 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNB3P54284 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNB3P54284 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNB3P54284 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNB3P54284 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNB3P54284 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNB3P54284 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNB3P54284 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNB3P54284 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNB3P54284 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNB3P54284 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNB3P54284 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNB3P54284 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNB3P54284 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNB3P54284 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNB3P54284 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNB3P54284 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNB3P54284 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNB3P54284 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNB3P54284 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNB3P54284 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNB3P54284 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNB3P54284 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNB3P54284 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNB3P54284 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNB3P54284 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNB3P54284 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNB3P54284 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNB3P54284 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNB3P54284 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNB3P54284 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNB3P54284 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNB3P54284 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNB3P54284 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNB3P54284 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNB3P54284 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNB3P54284 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNB3P54284 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNB3P54284 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNB3P54284 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNB3P54284 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNB3P54284 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNB3P54284 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNB3P54284 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNB3P54284 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNB3P54284 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNB3P54284 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNB3P54284 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNB3P54284 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNB3P54284 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNB3P54284 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNB3P54284 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNB3P54284 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNB3P54284 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNB3P54284 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNB3P54284 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNB3P54284 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNB3P54284 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNB3P54284 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNB3P54284 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNB3P54284 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNB3P54284 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNB3P54284 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms