Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms