Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms