Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GSK3BP49841 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms