Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLK1P49759 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLK1P49759 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLK1P49759 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLK1P49759 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLK1P49759 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLK1P49759 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLK1P49759 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLK1P49759 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLK1P49759 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLK1P49759 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLK1P49759 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLK1P49759 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLK1P49759 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLK1P49759 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLK1P49759 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLK1P49759 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLK1P49759 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLK1P49759 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLK1P49759 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLK1P49759 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLK1P49759 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLK1P49759 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLK1P49759 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CLK1P49759 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLK1P49759 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CLK1P49759 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLK1P49759 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CLK1P49759 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLK1P49759 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLK1P49759 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLK1P49759 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLK1P49759 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLK1P49759 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLK1P49759 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLK1P49759 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLK1P49759 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLK1P49759 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLK1P49759 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLK1P49759 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLK1P49759 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLK1P49759 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLK1P49759 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLK1P49759 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLK1P49759 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLK1P49759 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLK1P49759 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLK1P49759 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLK1P49759 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLK1P49759 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLK1P49759 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLK1P49759 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLK1P49759 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLK1P49759 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLK1P49759 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLK1P49759 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLK1P49759 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLK1P49759 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLK1P49759 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLK1P49759 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLK1P49759 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLK1P49759 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLK1P49759 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLK1P49759 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLK1P49759 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLK1P49759 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLK1P49759 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLK1P49759 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLK1P49759 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLK1P49759 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLK1P49759 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLK1P49759 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CLK1P49759 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLK1P49759 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLK1P49759 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLK1P49759 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CLK1P49759 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLK1P49759 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLK1P49759 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLK1P49759 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLK1P49759 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CLK1P49759 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CLK1P49759 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLK1P49759 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLK1P49759 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLK1P49759 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLK1P49759 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLK1P49759 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLK1P49759 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLK1P49759 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CLK1P49759 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CLK1P49759 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLK1P49759 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLK1P49759 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLK1P49759 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLK1P49759 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLK1P49759 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLK1P49759 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLK1P49759 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLK1P49759 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms