Protein–RNA interactions for Protein: P48664

SLC1A6, Excitatory amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A6P48664 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A6P48664 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A6P48664 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A6P48664 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A6P48664 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A6P48664 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A6P48664 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A6P48664 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A6P48664 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A6P48664 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A6P48664 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A6P48664 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A6P48664 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A6P48664 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A6P48664 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A6P48664 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A6P48664 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A6P48664 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A6P48664 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A6P48664 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A6P48664 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A6P48664 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A6P48664 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A6P48664 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A6P48664 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A6P48664 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A6P48664 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A6P48664 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A6P48664 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A6P48664 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A6P48664 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A6P48664 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A6P48664 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A6P48664 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A6P48664 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A6P48664 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC1A6P48664 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC1A6P48664 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC1A6P48664 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC1A6P48664 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC1A6P48664 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC1A6P48664 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC1A6P48664 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC1A6P48664 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC1A6P48664 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC1A6P48664 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC1A6P48664 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC1A6P48664 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC1A6P48664 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC1A6P48664 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC1A6P48664 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC1A6P48664 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC1A6P48664 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC1A6P48664 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC1A6P48664 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC1A6P48664 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC1A6P48664 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC1A6P48664 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC1A6P48664 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC1A6P48664 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC1A6P48664 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC1A6P48664 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC1A6P48664 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC1A6P48664 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC1A6P48664 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC1A6P48664 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC1A6P48664 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC1A6P48664 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC1A6P48664 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC1A6P48664 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC1A6P48664 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC1A6P48664 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC1A6P48664 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC1A6P48664 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC1A6P48664 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC1A6P48664 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC1A6P48664 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC1A6P48664 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC1A6P48664 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC1A6P48664 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC1A6P48664 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC1A6P48664 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC1A6P48664 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC1A6P48664 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC1A6P48664 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC1A6P48664 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC1A6P48664 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC1A6P48664 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC1A6P48664 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC1A6P48664 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC1A6P48664 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC1A6P48664 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC1A6P48664 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC1A6P48664 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC1A6P48664 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC1A6P48664 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC1A6P48664 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC1A6P48664 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC1A6P48664 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC1A6P48664 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms