Protein–RNA interactions for Protein: P48444

ARCN1, Coatomer subunit delta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARCN1P48444 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARCN1P48444 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARCN1P48444 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARCN1P48444 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARCN1P48444 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARCN1P48444 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARCN1P48444 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARCN1P48444 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARCN1P48444 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARCN1P48444 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARCN1P48444 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARCN1P48444 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARCN1P48444 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARCN1P48444 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARCN1P48444 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARCN1P48444 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARCN1P48444 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARCN1P48444 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARCN1P48444 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARCN1P48444 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARCN1P48444 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARCN1P48444 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARCN1P48444 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARCN1P48444 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARCN1P48444 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARCN1P48444 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARCN1P48444 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARCN1P48444 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARCN1P48444 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARCN1P48444 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARCN1P48444 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARCN1P48444 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARCN1P48444 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARCN1P48444 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARCN1P48444 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARCN1P48444 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARCN1P48444 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARCN1P48444 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARCN1P48444 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARCN1P48444 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARCN1P48444 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARCN1P48444 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARCN1P48444 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARCN1P48444 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARCN1P48444 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARCN1P48444 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARCN1P48444 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARCN1P48444 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARCN1P48444 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARCN1P48444 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARCN1P48444 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARCN1P48444 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARCN1P48444 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARCN1P48444 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARCN1P48444 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARCN1P48444 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARCN1P48444 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARCN1P48444 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARCN1P48444 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARCN1P48444 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARCN1P48444 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARCN1P48444 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARCN1P48444 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARCN1P48444 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARCN1P48444 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARCN1P48444 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARCN1P48444 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARCN1P48444 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARCN1P48444 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARCN1P48444 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARCN1P48444 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARCN1P48444 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARCN1P48444 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARCN1P48444 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ARCN1P48444 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARCN1P48444 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ARCN1P48444 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARCN1P48444 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARCN1P48444 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARCN1P48444 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARCN1P48444 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARCN1P48444 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARCN1P48444 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARCN1P48444 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARCN1P48444 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARCN1P48444 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARCN1P48444 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARCN1P48444 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARCN1P48444 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARCN1P48444 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARCN1P48444 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARCN1P48444 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARCN1P48444 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARCN1P48444 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARCN1P48444 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARCN1P48444 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ARCN1P48444 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARCN1P48444 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARCN1P48444 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARCN1P48444 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms