Protein–RNA interactions for Protein: P48169

GABRA4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA4P48169 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms