Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATRXP46100 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATRXP46100 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATRXP46100 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATRXP46100 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATRXP46100 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATRXP46100 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATRXP46100 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATRXP46100 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATRXP46100 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATRXP46100 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATRXP46100 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATRXP46100 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATRXP46100 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATRXP46100 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ATRXP46100 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ATRXP46100 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATRXP46100 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ATRXP46100 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATRXP46100 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATRXP46100 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATRXP46100 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATRXP46100 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATRXP46100 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATRXP46100 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATRXP46100 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATRXP46100 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ATRXP46100 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ATRXP46100 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATRXP46100 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ATRXP46100 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATRXP46100 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATRXP46100 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATRXP46100 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ATRXP46100 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ATRXP46100 MIR6816-201ENST00000620368 66 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ATRXP46100 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATRXP46100 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATRXP46100 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATRXP46100 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATRXP46100 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATRXP46100 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATRXP46100 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATRXP46100 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATRXP46100 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATRXP46100 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATRXP46100 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATRXP46100 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATRXP46100 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATRXP46100 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATRXP46100 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATRXP46100 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATRXP46100 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATRXP46100 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATRXP46100 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATRXP46100 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ATRXP46100 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATRXP46100 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ATRXP46100 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATRXP46100 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATRXP46100 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATRXP46100 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ATRXP46100 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ATRXP46100 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATRXP46100 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATRXP46100 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ATRXP46100 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATRXP46100 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATRXP46100 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ATRXP46100 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATRXP46100 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATRXP46100 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATRXP46100 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATRXP46100 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATRXP46100 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATRXP46100 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATRXP46100 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATRXP46100 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATRXP46100 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATRXP46100 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATRXP46100 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATRXP46100 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATRXP46100 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATRXP46100 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ATRXP46100 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATRXP46100 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ATRXP46100 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATRXP46100 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATRXP46100 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATRXP46100 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ATRXP46100 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATRXP46100 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ATRXP46100 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATRXP46100 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATRXP46100 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATRXP46100 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATRXP46100 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATRXP46100 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATRXP46100 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATRXP46100 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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