Protein–RNA interactions for Protein: P42262

GRIA2, Glutamate receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA2P42262 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIA2P42262 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.1 ms