Protein–RNA interactions for Protein: P40925

MDH1, Malate dehydrogenase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH1P40925 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MDH1P40925 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MDH1P40925 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MDH1P40925 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
MDH1P40925 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MDH1P40925 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
MDH1P40925 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MDH1P40925 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MDH1P40925 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
MDH1P40925 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MDH1P40925 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MDH1P40925 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MDH1P40925 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
MDH1P40925 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MDH1P40925 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MDH1P40925 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MDH1P40925 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MDH1P40925 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MDH1P40925 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MDH1P40925 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MDH1P40925 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MDH1P40925 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MDH1P40925 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MDH1P40925 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MDH1P40925 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
MDH1P40925 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MDH1P40925 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MDH1P40925 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MDH1P40925 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MDH1P40925 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MDH1P40925 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MDH1P40925 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MDH1P40925 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MDH1P40925 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MDH1P40925 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MDH1P40925 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MDH1P40925 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
MDH1P40925 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.21
MDH1P40925 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
MDH1P40925 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MDH1P40925 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
MDH1P40925 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MDH1P40925 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MDH1P40925 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MDH1P40925 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
MDH1P40925 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MDH1P40925 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MDH1P40925 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MDH1P40925 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MDH1P40925 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MDH1P40925 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MDH1P40925 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MDH1P40925 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MDH1P40925 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MDH1P40925 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MDH1P40925 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
MDH1P40925 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MDH1P40925 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MDH1P40925 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MDH1P40925 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MDH1P40925 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MDH1P40925 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MDH1P40925 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MDH1P40925 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MDH1P40925 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MDH1P40925 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MDH1P40925 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MDH1P40925 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MDH1P40925 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MDH1P40925 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MDH1P40925 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MDH1P40925 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MDH1P40925 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MDH1P40925 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MDH1P40925 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MDH1P40925 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
MDH1P40925 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MDH1P40925 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MDH1P40925 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MDH1P40925 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MDH1P40925 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MDH1P40925 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MDH1P40925 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MDH1P40925 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
MDH1P40925 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MDH1P40925 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MDH1P40925 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MDH1P40925 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MDH1P40925 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MDH1P40925 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MDH1P40925 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MDH1P40925 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MDH1P40925 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MDH1P40925 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MDH1P40925 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MDH1P40925 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
MDH1P40925 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MDH1P40925 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MDH1P40925 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MDH1P40925 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms