Protein–RNA interactions for Protein: P36871

PGM1, Phosphoglucomutase-1, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGM1P36871 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGM1P36871 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGM1P36871 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGM1P36871 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGM1P36871 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGM1P36871 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGM1P36871 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGM1P36871 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGM1P36871 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGM1P36871 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGM1P36871 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGM1P36871 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGM1P36871 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGM1P36871 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGM1P36871 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PGM1P36871 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGM1P36871 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGM1P36871 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGM1P36871 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGM1P36871 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGM1P36871 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGM1P36871 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGM1P36871 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGM1P36871 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGM1P36871 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGM1P36871 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGM1P36871 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGM1P36871 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGM1P36871 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGM1P36871 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGM1P36871 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGM1P36871 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGM1P36871 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGM1P36871 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGM1P36871 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PGM1P36871 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PGM1P36871 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PGM1P36871 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PGM1P36871 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PGM1P36871 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PGM1P36871 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PGM1P36871 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PGM1P36871 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PGM1P36871 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGM1P36871 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGM1P36871 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGM1P36871 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGM1P36871 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGM1P36871 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGM1P36871 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGM1P36871 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGM1P36871 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGM1P36871 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGM1P36871 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGM1P36871 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGM1P36871 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGM1P36871 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGM1P36871 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGM1P36871 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGM1P36871 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGM1P36871 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGM1P36871 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGM1P36871 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGM1P36871 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGM1P36871 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGM1P36871 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGM1P36871 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGM1P36871 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGM1P36871 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGM1P36871 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGM1P36871 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGM1P36871 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGM1P36871 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PGM1P36871 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGM1P36871 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PGM1P36871 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGM1P36871 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGM1P36871 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PGM1P36871 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGM1P36871 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGM1P36871 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGM1P36871 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGM1P36871 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGM1P36871 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGM1P36871 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGM1P36871 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGM1P36871 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGM1P36871 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGM1P36871 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PGM1P36871 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PGM1P36871 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PGM1P36871 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PGM1P36871 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PGM1P36871 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PGM1P36871 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PGM1P36871 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PGM1P36871 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PGM1P36871 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PGM1P36871 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PGM1P36871 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms