Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms