Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
OTX2P32243 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
OTX2P32243 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
OTX2P32243 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
OTX2P32243 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
OTX2P32243 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
OTX2P32243 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
OTX2P32243 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
OTX2P32243 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
OTX2P32243 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
OTX2P32243 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OTX2P32243 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
OTX2P32243 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
OTX2P32243 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OTX2P32243 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OTX2P32243 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OTX2P32243 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OTX2P32243 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.08■□□□□ 0
OTX2P32243 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
OTX2P32243 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
OTX2P32243 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
OTX2P32243 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
OTX2P32243 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
OTX2P32243 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OTX2P32243 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OTX2P32243 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OTX2P32243 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OTX2P32243 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OTX2P32243 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OTX2P32243 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
OTX2P32243 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
OTX2P32243 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OTX2P32243 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OTX2P32243 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OTX2P32243 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OTX2P32243 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OTX2P32243 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OTX2P32243 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.08■□□□□ 0
OTX2P32243 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.08■□□□□ 0
OTX2P32243 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.08■□□□□ 0
OTX2P32243 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OTX2P32243 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
OTX2P32243 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OTX2P32243 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OTX2P32243 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OTX2P32243 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
OTX2P32243 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OTX2P32243 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OTX2P32243 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OTX2P32243 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
OTX2P32243 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OTX2P32243 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OTX2P32243 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
OTX2P32243 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
OTX2P32243 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
OTX2P32243 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
OTX2P32243 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OTX2P32243 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
OTX2P32243 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
OTX2P32243 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
OTX2P32243 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OTX2P32243 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
OTX2P32243 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.07■□□□□ 0
OTX2P32243 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
OTX2P32243 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
OTX2P32243 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
OTX2P32243 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.07■□□□□ 0
OTX2P32243 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.07■□□□□ 0
OTX2P32243 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
OTX2P32243 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.07■□□□□ 0
OTX2P32243 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.07■□□□□ 0
OTX2P32243 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OTX2P32243 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
OTX2P32243 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
OTX2P32243 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
OTX2P32243 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OTX2P32243 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
OTX2P32243 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OTX2P32243 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OTX2P32243 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
OTX2P32243 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OTX2P32243 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.07■□□□□ 0
OTX2P32243 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
OTX2P32243 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OTX2P32243 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
OTX2P32243 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OTX2P32243 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OTX2P32243 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
OTX2P32243 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
OTX2P32243 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OTX2P32243 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
OTX2P32243 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
OTX2P32243 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OTX2P32243 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
OTX2P32243 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OTX2P32243 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OTX2P32243 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
OTX2P32243 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OTX2P32243 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OTX2P32243 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms