Protein–RNA interactions for Protein: P30085

CMPK1, UMP-CMP kinase, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK1P30085 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CMPK1P30085 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms