Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PLNP26678 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PLNP26678 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PLNP26678 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PLNP26678 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PLNP26678 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PLNP26678 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PLNP26678 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PLNP26678 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PLNP26678 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PLNP26678 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PLNP26678 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PLNP26678 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PLNP26678 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PLNP26678 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PLNP26678 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PLNP26678 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PLNP26678 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PLNP26678 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PLNP26678 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PLNP26678 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PLNP26678 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PLNP26678 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PLNP26678 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PLNP26678 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PLNP26678 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PLNP26678 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PLNP26678 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
PLNP26678 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PLNP26678 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PLNP26678 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PLNP26678 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PLNP26678 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
PLNP26678 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PLNP26678 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
PLNP26678 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PLNP26678 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PLNP26678 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PLNP26678 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PLNP26678 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PLNP26678 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PLNP26678 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PLNP26678 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PLNP26678 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PLNP26678 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PLNP26678 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PLNP26678 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PLNP26678 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PLNP26678 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PLNP26678 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PLNP26678 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PLNP26678 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PLNP26678 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PLNP26678 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PLNP26678 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PLNP26678 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PLNP26678 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
PLNP26678 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
PLNP26678 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PLNP26678 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
PLNP26678 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PLNP26678 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PLNP26678 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
PLNP26678 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
PLNP26678 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
PLNP26678 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PLNP26678 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
PLNP26678 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
PLNP26678 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PLNP26678 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PLNP26678 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
PLNP26678 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
PLNP26678 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PLNP26678 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
PLNP26678 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
PLNP26678 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
PLNP26678 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PLNP26678 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PLNP26678 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PLNP26678 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PLNP26678 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
PLNP26678 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PLNP26678 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PLNP26678 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
PLNP26678 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PLNP26678 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC11.46□□□□□ -0.57
PLNP26678 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
PLNP26678 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
PLNP26678 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
PLNP26678 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PLNP26678 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PLNP26678 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
PLNP26678 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
PLNP26678 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
PLNP26678 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
PLNP26678 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
PLNP26678 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
PLNP26678 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
PLNP26678 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
PLNP26678 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms