Protein–RNA interactions for Protein: P23434

GCSH, Glycine cleavage system H protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP23434 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
GCSHP23434 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
GCSHP23434 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
GCSHP23434 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
GCSHP23434 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
GCSHP23434 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
GCSHP23434 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
GCSHP23434 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
GCSHP23434 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
GCSHP23434 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
GCSHP23434 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
GCSHP23434 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
GCSHP23434 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC11.92□□□□□ -0.5
GCSHP23434 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
GCSHP23434 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
GCSHP23434 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
GCSHP23434 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
GCSHP23434 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
GCSHP23434 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
GCSHP23434 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
GCSHP23434 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
GCSHP23434 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
GCSHP23434 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
GCSHP23434 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
GCSHP23434 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
GCSHP23434 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
GCSHP23434 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
GCSHP23434 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
GCSHP23434 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
GCSHP23434 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
GCSHP23434 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
GCSHP23434 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
GCSHP23434 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
GCSHP23434 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
GCSHP23434 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
GCSHP23434 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
GCSHP23434 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
GCSHP23434 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
GCSHP23434 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
GCSHP23434 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.92□□□□□ -0.5
GCSHP23434 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
GCSHP23434 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
GCSHP23434 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
GCSHP23434 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
GCSHP23434 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
GCSHP23434 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
GCSHP23434 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
GCSHP23434 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
GCSHP23434 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
GCSHP23434 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
GCSHP23434 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
GCSHP23434 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
GCSHP23434 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
GCSHP23434 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
GCSHP23434 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
GCSHP23434 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.92□□□□□ -0.5
GCSHP23434 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
GCSHP23434 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
GCSHP23434 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
GCSHP23434 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
GCSHP23434 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
GCSHP23434 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
GCSHP23434 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
GCSHP23434 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
GCSHP23434 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
GCSHP23434 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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GCSHP23434 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
GCSHP23434 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
GCSHP23434 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
GCSHP23434 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
GCSHP23434 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
GCSHP23434 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
GCSHP23434 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
GCSHP23434 CCBE1-201ENST00000398179 5979 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
GCSHP23434 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
GCSHP23434 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
GCSHP23434 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
GCSHP23434 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
GCSHP23434 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
GCSHP23434 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
GCSHP23434 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
GCSHP23434 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
GCSHP23434 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
GCSHP23434 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
GCSHP23434 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
GCSHP23434 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
GCSHP23434 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
GCSHP23434 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
GCSHP23434 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
GCSHP23434 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
GCSHP23434 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
GCSHP23434 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
GCSHP23434 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
GCSHP23434 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
GCSHP23434 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
GCSHP23434 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
GCSHP23434 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
GCSHP23434 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
GCSHP23434 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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