Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CREB1P16220 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CREB1P16220 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CREB1P16220 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CREB1P16220 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CREB1P16220 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CREB1P16220 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CREB1P16220 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CREB1P16220 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CREB1P16220 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CREB1P16220 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CREB1P16220 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CREB1P16220 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CREB1P16220 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CREB1P16220 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CREB1P16220 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CREB1P16220 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CREB1P16220 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CREB1P16220 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CREB1P16220 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CREB1P16220 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CREB1P16220 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CREB1P16220 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CREB1P16220 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CREB1P16220 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CREB1P16220 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CREB1P16220 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CREB1P16220 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CREB1P16220 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CREB1P16220 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CREB1P16220 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CREB1P16220 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CREB1P16220 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CREB1P16220 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CREB1P16220 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CREB1P16220 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CREB1P16220 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CREB1P16220 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CREB1P16220 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CREB1P16220 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CREB1P16220 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CREB1P16220 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CREB1P16220 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CREB1P16220 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CREB1P16220 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CREB1P16220 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CREB1P16220 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CREB1P16220 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CREB1P16220 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CREB1P16220 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CREB1P16220 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CREB1P16220 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CREB1P16220 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CREB1P16220 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CREB1P16220 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CREB1P16220 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CREB1P16220 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CREB1P16220 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CREB1P16220 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CREB1P16220 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CREB1P16220 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CREB1P16220 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CREB1P16220 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CREB1P16220 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CREB1P16220 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CREB1P16220 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CREB1P16220 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CREB1P16220 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CREB1P16220 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CREB1P16220 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CREB1P16220 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CREB1P16220 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CREB1P16220 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CREB1P16220 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CREB1P16220 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CREB1P16220 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CREB1P16220 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CREB1P16220 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CREB1P16220 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CREB1P16220 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CREB1P16220 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CREB1P16220 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CREB1P16220 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CREB1P16220 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CREB1P16220 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CREB1P16220 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CREB1P16220 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CREB1P16220 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CREB1P16220 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CREB1P16220 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CREB1P16220 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CREB1P16220 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CREB1P16220 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CREB1P16220 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CREB1P16220 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CREB1P16220 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CREB1P16220 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CREB1P16220 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CREB1P16220 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CREB1P16220 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms