Protein–RNA interactions for Protein: P13747

HLA-E, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain E, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-EP13747 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-EP13747 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-EP13747 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-EP13747 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-EP13747 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-EP13747 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-EP13747 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-EP13747 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-EP13747 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-EP13747 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-EP13747 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-EP13747 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-EP13747 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-EP13747 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-EP13747 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-EP13747 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-EP13747 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-EP13747 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-EP13747 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-EP13747 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-EP13747 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-EP13747 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-EP13747 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-EP13747 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-EP13747 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-EP13747 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-EP13747 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-EP13747 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-EP13747 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-EP13747 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-EP13747 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-EP13747 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-EP13747 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-EP13747 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-EP13747 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-EP13747 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-EP13747 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-EP13747 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-EP13747 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-EP13747 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-EP13747 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-EP13747 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-EP13747 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-EP13747 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-EP13747 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-EP13747 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-EP13747 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-EP13747 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-EP13747 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-EP13747 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-EP13747 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-EP13747 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-EP13747 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-EP13747 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-EP13747 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-EP13747 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-EP13747 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-EP13747 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-EP13747 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-EP13747 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-EP13747 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-EP13747 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-EP13747 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-EP13747 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-EP13747 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-EP13747 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-EP13747 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-EP13747 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-EP13747 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-EP13747 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-EP13747 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-EP13747 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-EP13747 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-EP13747 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-EP13747 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-EP13747 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-EP13747 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-EP13747 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-EP13747 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-EP13747 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-EP13747 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-EP13747 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-EP13747 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-EP13747 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-EP13747 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-EP13747 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-EP13747 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-EP13747 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-EP13747 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-EP13747 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-EP13747 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-EP13747 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-EP13747 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-EP13747 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-EP13747 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-EP13747 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-EP13747 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-EP13747 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-EP13747 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-EP13747 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms