Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH1P12830 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH1P12830 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH1P12830 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH1P12830 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH1P12830 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH1P12830 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH1P12830 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH1P12830 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH1P12830 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH1P12830 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH1P12830 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDH1P12830 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDH1P12830 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDH1P12830 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDH1P12830 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDH1P12830 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDH1P12830 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDH1P12830 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDH1P12830 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDH1P12830 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDH1P12830 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDH1P12830 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDH1P12830 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDH1P12830 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDH1P12830 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDH1P12830 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDH1P12830 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDH1P12830 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDH1P12830 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDH1P12830 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDH1P12830 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDH1P12830 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDH1P12830 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDH1P12830 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDH1P12830 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDH1P12830 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDH1P12830 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CDH1P12830 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDH1P12830 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDH1P12830 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDH1P12830 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDH1P12830 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDH1P12830 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDH1P12830 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDH1P12830 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDH1P12830 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDH1P12830 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDH1P12830 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDH1P12830 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDH1P12830 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDH1P12830 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDH1P12830 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDH1P12830 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDH1P12830 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDH1P12830 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDH1P12830 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDH1P12830 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH1P12830 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH1P12830 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH1P12830 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH1P12830 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH1P12830 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH1P12830 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH1P12830 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH1P12830 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH1P12830 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH1P12830 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH1P12830 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH1P12830 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH1P12830 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH1P12830 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH1P12830 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH1P12830 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH1P12830 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH1P12830 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH1P12830 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH1P12830 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH1P12830 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH1P12830 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH1P12830 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH1P12830 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH1P12830 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH1P12830 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH1P12830 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH1P12830 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH1P12830 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH1P12830 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH1P12830 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH1P12830 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH1P12830 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH1P12830 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH1P12830 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH1P12830 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH1P12830 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH1P12830 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH1P12830 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH1P12830 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH1P12830 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH1P12830 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms