Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC10.48□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC10.48□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC10.48□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms