Protein–RNA interactions for Protein: P11441

UBL4A, Ubiquitin-like protein 4A, humanhuman

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Length 157 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL4AP11441 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBL4AP11441 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBL4AP11441 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBL4AP11441 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
UBL4AP11441 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBL4AP11441 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBL4AP11441 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBL4AP11441 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBL4AP11441 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBL4AP11441 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBL4AP11441 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
UBL4AP11441 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBL4AP11441 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBL4AP11441 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBL4AP11441 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBL4AP11441 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBL4AP11441 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
UBL4AP11441 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBL4AP11441 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBL4AP11441 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
UBL4AP11441 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
UBL4AP11441 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
UBL4AP11441 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
UBL4AP11441 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
UBL4AP11441 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBL4AP11441 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
UBL4AP11441 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UBL4AP11441 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBL4AP11441 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.08■□□□□ 0
UBL4AP11441 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBL4AP11441 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
UBL4AP11441 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBL4AP11441 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UBL4AP11441 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBL4AP11441 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
UBL4AP11441 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBL4AP11441 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
UBL4AP11441 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
UBL4AP11441 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
UBL4AP11441 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
UBL4AP11441 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBL4AP11441 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBL4AP11441 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBL4AP11441 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
UBL4AP11441 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBL4AP11441 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBL4AP11441 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UBL4AP11441 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBL4AP11441 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
UBL4AP11441 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBL4AP11441 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBL4AP11441 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
UBL4AP11441 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
UBL4AP11441 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBL4AP11441 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBL4AP11441 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBL4AP11441 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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UBL4AP11441 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
UBL4AP11441 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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UBL4AP11441 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBL4AP11441 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBL4AP11441 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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UBL4AP11441 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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UBL4AP11441 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBL4AP11441 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBL4AP11441 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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UBL4AP11441 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBL4AP11441 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBL4AP11441 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBL4AP11441 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UBL4AP11441 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBL4AP11441 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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UBL4AP11441 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
UBL4AP11441 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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UBL4AP11441 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBL4AP11441 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UBL4AP11441 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBL4AP11441 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBL4AP11441 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBL4AP11441 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBL4AP11441 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBL4AP11441 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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