Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TMEM225BP0DP42 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TMEM225BP0DP42 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TMEM225BP0DP42 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TMEM225BP0DP42 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TMEM225BP0DP42 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TMEM225BP0DP42 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TMEM225BP0DP42 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TMEM225BP0DP42 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TMEM225BP0DP42 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TMEM225BP0DP42 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TMEM225BP0DP42 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TMEM225BP0DP42 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TMEM225BP0DP42 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TMEM225BP0DP42 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TMEM225BP0DP42 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TMEM225BP0DP42 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TMEM225BP0DP42 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TMEM225BP0DP42 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TMEM225BP0DP42 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TMEM225BP0DP42 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TMEM225BP0DP42 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TMEM225BP0DP42 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TMEM225BP0DP42 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TMEM225BP0DP42 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TMEM225BP0DP42 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TMEM225BP0DP42 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TMEM225BP0DP42 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TMEM225BP0DP42 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TMEM225BP0DP42 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TMEM225BP0DP42 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TMEM225BP0DP42 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TMEM225BP0DP42 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TMEM225BP0DP42 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TMEM225BP0DP42 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TMEM225BP0DP42 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TMEM225BP0DP42 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TMEM225BP0DP42 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TMEM225BP0DP42 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TMEM225BP0DP42 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TMEM225BP0DP42 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TMEM225BP0DP42 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TMEM225BP0DP42 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TMEM225BP0DP42 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TMEM225BP0DP42 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
TMEM225BP0DP42 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TMEM225BP0DP42 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TMEM225BP0DP42 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TMEM225BP0DP42 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TMEM225BP0DP42 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TMEM225BP0DP42 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
TMEM225BP0DP42 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TMEM225BP0DP42 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
TMEM225BP0DP42 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TMEM225BP0DP42 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TMEM225BP0DP42 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
TMEM225BP0DP42 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TMEM225BP0DP42 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TMEM225BP0DP42 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
TMEM225BP0DP42 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TMEM225BP0DP42 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TMEM225BP0DP42 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TMEM225BP0DP42 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TMEM225BP0DP42 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TMEM225BP0DP42 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TMEM225BP0DP42 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
TMEM225BP0DP42 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TMEM225BP0DP42 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TMEM225BP0DP42 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TMEM225BP0DP42 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TMEM225BP0DP42 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TMEM225BP0DP42 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TMEM225BP0DP42 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TMEM225BP0DP42 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TMEM225BP0DP42 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TMEM225BP0DP42 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TMEM225BP0DP42 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TMEM225BP0DP42 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
TMEM225BP0DP42 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TMEM225BP0DP42 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TMEM225BP0DP42 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TMEM225BP0DP42 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TMEM225BP0DP42 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
TMEM225BP0DP42 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
TMEM225BP0DP42 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TMEM225BP0DP42 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TMEM225BP0DP42 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
TMEM225BP0DP42 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TMEM225BP0DP42 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TMEM225BP0DP42 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TMEM225BP0DP42 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TMEM225BP0DP42 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TMEM225BP0DP42 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
TMEM225BP0DP42 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TMEM225BP0DP42 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TMEM225BP0DP42 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TMEM225BP0DP42 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
TMEM225BP0DP42 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TMEM225BP0DP42 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TMEM225BP0DP42 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87 ms