Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGAVP06756 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGAVP06756 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGAVP06756 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGAVP06756 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGAVP06756 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGAVP06756 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGAVP06756 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGAVP06756 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGAVP06756 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGAVP06756 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGAVP06756 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGAVP06756 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGAVP06756 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGAVP06756 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGAVP06756 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGAVP06756 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGAVP06756 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGAVP06756 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGAVP06756 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGAVP06756 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGAVP06756 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGAVP06756 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGAVP06756 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGAVP06756 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGAVP06756 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGAVP06756 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGAVP06756 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGAVP06756 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGAVP06756 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGAVP06756 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGAVP06756 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGAVP06756 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGAVP06756 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGAVP06756 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGAVP06756 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGAVP06756 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGAVP06756 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGAVP06756 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGAVP06756 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGAVP06756 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGAVP06756 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGAVP06756 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGAVP06756 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGAVP06756 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGAVP06756 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGAVP06756 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGAVP06756 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGAVP06756 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGAVP06756 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGAVP06756 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGAVP06756 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGAVP06756 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGAVP06756 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGAVP06756 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGAVP06756 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGAVP06756 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGAVP06756 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGAVP06756 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGAVP06756 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGAVP06756 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGAVP06756 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGAVP06756 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGAVP06756 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGAVP06756 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGAVP06756 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGAVP06756 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGAVP06756 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGAVP06756 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGAVP06756 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGAVP06756 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGAVP06756 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGAVP06756 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGAVP06756 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGAVP06756 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGAVP06756 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGAVP06756 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGAVP06756 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGAVP06756 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGAVP06756 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGAVP06756 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGAVP06756 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGAVP06756 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGAVP06756 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGAVP06756 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGAVP06756 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGAVP06756 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGAVP06756 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGAVP06756 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGAVP06756 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGAVP06756 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGAVP06756 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGAVP06756 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGAVP06756 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGAVP06756 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
ITGAVP06756 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ITGAVP06756 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
ITGAVP06756 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ITGAVP06756 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ITGAVP06756 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms