Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGB3P05106 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGB3P05106 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGB3P05106 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGB3P05106 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGB3P05106 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGB3P05106 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGB3P05106 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGB3P05106 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGB3P05106 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGB3P05106 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGB3P05106 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGB3P05106 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGB3P05106 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGB3P05106 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGB3P05106 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGB3P05106 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGB3P05106 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGB3P05106 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGB3P05106 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGB3P05106 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGB3P05106 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGB3P05106 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGB3P05106 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGB3P05106 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGB3P05106 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGB3P05106 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGB3P05106 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGB3P05106 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGB3P05106 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGB3P05106 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGB3P05106 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGB3P05106 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGB3P05106 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGB3P05106 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGB3P05106 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGB3P05106 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGB3P05106 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGB3P05106 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGB3P05106 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGB3P05106 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGB3P05106 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGB3P05106 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGB3P05106 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGB3P05106 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGB3P05106 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGB3P05106 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGB3P05106 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGB3P05106 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGB3P05106 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGB3P05106 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGB3P05106 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGB3P05106 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGB3P05106 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGB3P05106 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGB3P05106 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGB3P05106 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGB3P05106 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGB3P05106 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGB3P05106 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGB3P05106 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGB3P05106 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGB3P05106 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGB3P05106 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGB3P05106 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGB3P05106 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGB3P05106 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGB3P05106 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGB3P05106 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGB3P05106 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGB3P05106 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGB3P05106 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGB3P05106 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGB3P05106 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGB3P05106 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGB3P05106 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGB3P05106 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGB3P05106 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGB3P05106 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGB3P05106 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGB3P05106 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGB3P05106 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGB3P05106 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGB3P05106 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGB3P05106 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGB3P05106 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGB3P05106 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGB3P05106 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGB3P05106 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGB3P05106 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGB3P05106 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGB3P05106 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGB3P05106 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGB3P05106 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGB3P05106 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGB3P05106 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGB3P05106 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGB3P05106 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGB3P05106 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGB3P05106 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms