Protein–RNA interactions for Protein: P02549

SPTA1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,419 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTA1P02549 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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SPTA1P02549 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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