Protein–RNA interactions for Protein: O95754

SEMA4F, Semaphorin-4F, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4FO95754 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SEMA4FO95754 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SEMA4FO95754 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SEMA4FO95754 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SEMA4FO95754 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SEMA4FO95754 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA4FO95754 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA4FO95754 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA4FO95754 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA4FO95754 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA4FO95754 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA4FO95754 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA4FO95754 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA4FO95754 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA4FO95754 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA4FO95754 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA4FO95754 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA4FO95754 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA4FO95754 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA4FO95754 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA4FO95754 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA4FO95754 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA4FO95754 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA4FO95754 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA4FO95754 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA4FO95754 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA4FO95754 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA4FO95754 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA4FO95754 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA4FO95754 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA4FO95754 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA4FO95754 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA4FO95754 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA4FO95754 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA4FO95754 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA4FO95754 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA4FO95754 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA4FO95754 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA4FO95754 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA4FO95754 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA4FO95754 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA4FO95754 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA4FO95754 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA4FO95754 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA4FO95754 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA4FO95754 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA4FO95754 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA4FO95754 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA4FO95754 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA4FO95754 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA4FO95754 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA4FO95754 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA4FO95754 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA4FO95754 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA4FO95754 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA4FO95754 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA4FO95754 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA4FO95754 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA4FO95754 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA4FO95754 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA4FO95754 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA4FO95754 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA4FO95754 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA4FO95754 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA4FO95754 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA4FO95754 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA4FO95754 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA4FO95754 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA4FO95754 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA4FO95754 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA4FO95754 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA4FO95754 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA4FO95754 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA4FO95754 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA4FO95754 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA4FO95754 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA4FO95754 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA4FO95754 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA4FO95754 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA4FO95754 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA4FO95754 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA4FO95754 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA4FO95754 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA4FO95754 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA4FO95754 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA4FO95754 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA4FO95754 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA4FO95754 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA4FO95754 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms