Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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CLDN9O95484 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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CLDN9O95484 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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