Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SKAP2O75563 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms