Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PPLO60437 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PPLO60437 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PPLO60437 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPLO60437 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPLO60437 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPLO60437 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPLO60437 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPLO60437 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPLO60437 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPLO60437 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPLO60437 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPLO60437 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPLO60437 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPLO60437 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PPLO60437 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPLO60437 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PPLO60437 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPLO60437 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPLO60437 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPLO60437 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPLO60437 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPLO60437 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPLO60437 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPLO60437 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPLO60437 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPLO60437 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPLO60437 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPLO60437 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPLO60437 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPLO60437 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPLO60437 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPLO60437 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPLO60437 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPLO60437 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPLO60437 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPLO60437 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPLO60437 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPLO60437 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPLO60437 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPLO60437 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPLO60437 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPLO60437 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPLO60437 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPLO60437 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPLO60437 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPLO60437 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPLO60437 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PPLO60437 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PPLO60437 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPLO60437 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPLO60437 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPLO60437 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPLO60437 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPLO60437 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPLO60437 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPLO60437 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPLO60437 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPLO60437 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPLO60437 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPLO60437 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPLO60437 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPLO60437 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPLO60437 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPLO60437 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PPLO60437 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPLO60437 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPLO60437 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPLO60437 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPLO60437 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPLO60437 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PPLO60437 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPLO60437 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPLO60437 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PPLO60437 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPLO60437 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPLO60437 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPLO60437 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPLO60437 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPLO60437 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPLO60437 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPLO60437 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPLO60437 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPLO60437 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPLO60437 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PPLO60437 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPLO60437 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PPLO60437 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPLO60437 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPLO60437 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPLO60437 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPLO60437 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPLO60437 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPLO60437 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPLO60437 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPLO60437 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPLO60437 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPLO60437 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPLO60437 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPLO60437 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms