Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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