Protein–RNA interactions for Protein: O43157

PLXNB1, Plexin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 2,135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNB1O43157 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
PLXNB1O43157 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PLXNB1O43157 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PLXNB1O43157 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PLXNB1O43157 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PLXNB1O43157 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PLXNB1O43157 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
PLXNB1O43157 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PLXNB1O43157 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms