Protein–RNA interactions for Protein: O15013

ARHGEF10, Rho guanine nucleotide exchange factor 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF10O15013 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARHGEF10O15013 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARHGEF10O15013 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARHGEF10O15013 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARHGEF10O15013 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARHGEF10O15013 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARHGEF10O15013 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARHGEF10O15013 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARHGEF10O15013 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARHGEF10O15013 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARHGEF10O15013 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARHGEF10O15013 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARHGEF10O15013 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARHGEF10O15013 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARHGEF10O15013 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARHGEF10O15013 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARHGEF10O15013 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARHGEF10O15013 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARHGEF10O15013 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARHGEF10O15013 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARHGEF10O15013 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARHGEF10O15013 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARHGEF10O15013 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARHGEF10O15013 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARHGEF10O15013 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARHGEF10O15013 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARHGEF10O15013 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARHGEF10O15013 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARHGEF10O15013 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARHGEF10O15013 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARHGEF10O15013 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARHGEF10O15013 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARHGEF10O15013 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARHGEF10O15013 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARHGEF10O15013 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARHGEF10O15013 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ARHGEF10O15013 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARHGEF10O15013 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARHGEF10O15013 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARHGEF10O15013 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARHGEF10O15013 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARHGEF10O15013 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARHGEF10O15013 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARHGEF10O15013 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARHGEF10O15013 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARHGEF10O15013 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARHGEF10O15013 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARHGEF10O15013 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARHGEF10O15013 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARHGEF10O15013 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARHGEF10O15013 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARHGEF10O15013 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARHGEF10O15013 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARHGEF10O15013 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARHGEF10O15013 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARHGEF10O15013 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARHGEF10O15013 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARHGEF10O15013 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARHGEF10O15013 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ARHGEF10O15013 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ARHGEF10O15013 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARHGEF10O15013 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARHGEF10O15013 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARHGEF10O15013 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARHGEF10O15013 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARHGEF10O15013 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARHGEF10O15013 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARHGEF10O15013 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARHGEF10O15013 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARHGEF10O15013 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARHGEF10O15013 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARHGEF10O15013 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARHGEF10O15013 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARHGEF10O15013 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARHGEF10O15013 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARHGEF10O15013 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARHGEF10O15013 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARHGEF10O15013 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARHGEF10O15013 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARHGEF10O15013 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARHGEF10O15013 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARHGEF10O15013 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARHGEF10O15013 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARHGEF10O15013 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARHGEF10O15013 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARHGEF10O15013 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARHGEF10O15013 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ARHGEF10O15013 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARHGEF10O15013 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARHGEF10O15013 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARHGEF10O15013 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARHGEF10O15013 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARHGEF10O15013 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARHGEF10O15013 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARHGEF10O15013 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARHGEF10O15013 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARHGEF10O15013 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARHGEF10O15013 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARHGEF10O15013 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARHGEF10O15013 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms