Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F3O00716 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F3O00716 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F3O00716 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F3O00716 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F3O00716 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F3O00716 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F3O00716 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F3O00716 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F3O00716 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F3O00716 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F3O00716 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F3O00716 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F3O00716 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F3O00716 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F3O00716 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F3O00716 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F3O00716 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F3O00716 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F3O00716 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
E2F3O00716 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
E2F3O00716 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
E2F3O00716 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
E2F3O00716 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
E2F3O00716 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
E2F3O00716 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
E2F3O00716 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
E2F3O00716 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
E2F3O00716 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
E2F3O00716 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
E2F3O00716 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
E2F3O00716 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
E2F3O00716 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
E2F3O00716 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
E2F3O00716 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
E2F3O00716 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
E2F3O00716 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
E2F3O00716 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
E2F3O00716 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
E2F3O00716 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
E2F3O00716 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
E2F3O00716 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
E2F3O00716 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
E2F3O00716 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
E2F3O00716 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
E2F3O00716 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
E2F3O00716 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
E2F3O00716 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
E2F3O00716 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
E2F3O00716 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
E2F3O00716 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
E2F3O00716 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
E2F3O00716 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
E2F3O00716 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
E2F3O00716 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
E2F3O00716 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
E2F3O00716 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
E2F3O00716 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
E2F3O00716 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
E2F3O00716 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
E2F3O00716 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
E2F3O00716 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
E2F3O00716 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
E2F3O00716 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
E2F3O00716 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
E2F3O00716 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
E2F3O00716 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
E2F3O00716 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
E2F3O00716 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
E2F3O00716 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
E2F3O00716 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
E2F3O00716 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
E2F3O00716 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
E2F3O00716 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
E2F3O00716 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
E2F3O00716 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
E2F3O00716 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
E2F3O00716 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
E2F3O00716 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
E2F3O00716 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
E2F3O00716 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
E2F3O00716 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
E2F3O00716 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
E2F3O00716 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
E2F3O00716 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
E2F3O00716 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
E2F3O00716 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
E2F3O00716 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
E2F3O00716 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
E2F3O00716 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
E2F3O00716 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
E2F3O00716 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
E2F3O00716 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
E2F3O00716 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
E2F3O00716 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
E2F3O00716 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
E2F3O00716 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
E2F3O00716 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
E2F3O00716 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
E2F3O00716 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms