Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLDN25C9JDP6 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
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CLDN25C9JDP6 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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