Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
SMIM1B2RUZ4 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM1B2RUZ4 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.1 ms