Protein–RNA interactions for Protein: A6NFD8

HELT, Hairy and enhancer of split-related protein HELT, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELTA6NFD8 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HELTA6NFD8 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HELTA6NFD8 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HELTA6NFD8 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HELTA6NFD8 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HELTA6NFD8 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HELTA6NFD8 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HELTA6NFD8 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HELTA6NFD8 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HELTA6NFD8 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HELTA6NFD8 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HELTA6NFD8 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HELTA6NFD8 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HELTA6NFD8 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HELTA6NFD8 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HELTA6NFD8 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HELTA6NFD8 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HELTA6NFD8 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HELTA6NFD8 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HELTA6NFD8 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HELTA6NFD8 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HELTA6NFD8 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HELTA6NFD8 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
HELTA6NFD8 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HELTA6NFD8 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HELTA6NFD8 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HELTA6NFD8 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HELTA6NFD8 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HELTA6NFD8 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HELTA6NFD8 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HELTA6NFD8 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HELTA6NFD8 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HELTA6NFD8 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HELTA6NFD8 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HELTA6NFD8 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HELTA6NFD8 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HELTA6NFD8 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HELTA6NFD8 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HELTA6NFD8 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HELTA6NFD8 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HELTA6NFD8 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HELTA6NFD8 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HELTA6NFD8 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HELTA6NFD8 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HELTA6NFD8 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HELTA6NFD8 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HELTA6NFD8 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HELTA6NFD8 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HELTA6NFD8 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HELTA6NFD8 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HELTA6NFD8 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
HELTA6NFD8 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HELTA6NFD8 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HELTA6NFD8 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HELTA6NFD8 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HELTA6NFD8 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HELTA6NFD8 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HELTA6NFD8 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HELTA6NFD8 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HELTA6NFD8 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HELTA6NFD8 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HELTA6NFD8 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HELTA6NFD8 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HELTA6NFD8 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HELTA6NFD8 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HELTA6NFD8 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HELTA6NFD8 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HELTA6NFD8 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HELTA6NFD8 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HELTA6NFD8 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HELTA6NFD8 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HELTA6NFD8 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HELTA6NFD8 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HELTA6NFD8 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HELTA6NFD8 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HELTA6NFD8 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HELTA6NFD8 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HELTA6NFD8 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HELTA6NFD8 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HELTA6NFD8 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HELTA6NFD8 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HELTA6NFD8 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HELTA6NFD8 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HELTA6NFD8 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HELTA6NFD8 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HELTA6NFD8 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HELTA6NFD8 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HELTA6NFD8 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
HELTA6NFD8 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HELTA6NFD8 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HELTA6NFD8 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HELTA6NFD8 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HELTA6NFD8 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HELTA6NFD8 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HELTA6NFD8 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HELTA6NFD8 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HELTA6NFD8 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
HELTA6NFD8 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HELTA6NFD8 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HELTA6NFD8 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms