Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSDA5PKW4 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms